1.不可思议的穿越 2.迷路的偶遇 3.旅行与约定 7.莉莉丝博士 8.鲤鱼王和穿越者 9.傲娇最难办 11.路霸与小遥 16.迷糊的进化 18.命运与未开始的剧情 番外：喷火龙的回忆 20.收复错误的雨翅蛾 21.迷路的保育家——曾经的劲敌登场！ 23.风月的醒悟 中秋番外：婚后神奇宝贝们的生活 24.保育家任务——闪光水君大作战（1） 25.保育家任务——闪光水君大作战（2） 26.保育家任务——闪光水君大作战（3） 27.保育家任务——闪光水君大作战（4） 28.拉鲁兹市、红琳再次登场！ 29.对战塔——米可利与红琳的对战！ 30.华丽大赛，小瞬 31.第二枚缎带，前往关东，呆呆兽，赤 32.不为人知的谈话 33.真新镇，大木博士，信 34.小智与小茂 35.夏令营 36.华丽的表演 37.神秘的声音 38.弟弟，奇鲁莉安 39.沙奈朵的记忆 40.挑战者 41.叶沐 43.冠军挑战赛（2） 44.冠军挑战赛（3） 45.冠军挑战赛（4） 46.冠军挑战赛（5） 47.冠军挑战赛（终） 番外：婚礼 48.新的任务 49.雅典娜 50.皮皮 51.守护者 52.倒霉的渡…… 53实力恐怖的关都四天王 54.向卡洛斯前进！ 55.布拉塔诺博士与艾岚 56.旅行 57.呱呱泡蛙 58.一起旅行吧！ 59.冠军联谊赛开始！ 60.雪儿VS卡露乃 61.mega进化vs伪mega进化 62.论中二与压榨劳动力 63.论苦逼与富二代 64.结束与新的消息 65.真实 66.等剧情 67.中二哥哥 68.芳缘剧情开始 69.最终的序章 70.终章